Dalam permainan Zen Cube 3d anda akan menyelesaikan teka-teki yang tergolong dalam kategori tiga berturut-turut. Di hadapan anda pada skrin anda akan melihat kiub, yang terdiri daripada kiub kecil. Pada setiap kiub kecil anda akan melihat imej yang digunakan untuk beberapa objek. Menggunakan tetikus, anda perlu menyeret kiub dengan imej yang sama ke panel khas. Dengan meletakkan tiga imej yang sama dalam satu baris, anda akan melihat bagaimana ia hilang dari padang permainan dan anda akan diberikan mata untuk ini dalam permainan Zen Cube 3d.