Dalam permainan Muscle Girl Calorie Run anda akan membantu seorang atlet perempuan berlatih dalam sukan seperti berlari. Di hadapan anda pada skrin anda akan melihat treadmill di mana watak anda akan bergerak. Semasa mengawal larian gadis itu, anda perlu mengelakkan halangan dan perangkap. Sepanjang perjalanan, anda akan membantunya mengumpul makanan sihat yang akan memberi kekuatan kepadanya. Dalam permainan Muscle Girl Calorie Run, anda juga perlu mengelakkan makanan berbahaya dan berkalori tinggi.