Dalam Pokemon Shoot 2, anda perlu melindungi rumah anda daripada menyerang Pokemon. Untuk menangkis serangan, anda perlu menggunakan pistol. Lihat dengan teliti pada skrin. Sebaik sahaja anda melihat Pokémon, anda perlu menangkap salah satu daripadanya dalam skop senjata anda dan tarik picu. Peluru yang mengenai Pokemon akan memusnahkannya dan untuk ini anda akan diberikan sejumlah mata dalam permainan Pokemon Shoot 2.